Существует версия, что усадьба была основана в конце XVIII века Ярославским и Вологодским генерал-губернатором Алексеем Петровичем Мельгуновым (1722–1788), одним из первых русских археологов, талантливым администратором. Любитель театра и покровитель муз, он позаботился о том, чтобы в Вологде была заложена традиция театральных представлений. Уже при открытии наместничества по его распоряжению «даваны были в разные числа балы, консерты, маскерады и комедии». По предложению Алексея Петровича в 1780-х годах Засодимский «сочинял топографическое, географическое и историческое описание всему Вологодскому наместничеству по трем в тогдашнее время большим областям», содержащее весьма ценные сведения последней четверти XVIII века.
Документально подтверждено, что в 1816 году владельцем усадьбы был подпоручик Александр Васильевич Мельгунов.
Последними хозяевами называют разных людей: кто Сергея Павловича, Василия Павловича и Марию Павловну Богословских (по крайней мере в 1907 году хозяевами были Богословские), кто – помещика Нечаева, который мечтал построить в Дудинском текстильную фабрику, но революция эти планы сорвала. По мнению большого знатока вологодских древностей Игоря Борисовича Воронина, последней владелицей дома была Мария Павловна Богословская.
Интересно, что зимой 1966 года здесь снимался эпизод фильма «Дядюшкин сон» режиссера К. Воинова.