В 1785 году в Великом Устюге началось строительство каменной и деревянной гражданской архитектуры по первому генеральному плану города, высочайше конфирмированному Екатериной II 16 января 1784 года. Для каменной застройки отводились два квартала, расположенные по главной улице города (современному Советскому проспекту), при этом во время строительства зданий необходимо было использовать типовой проект «фасадов примерных».

Именно на Советском проспекте по заказу купца второй гильдии Дмитрия Николаевича Толоконцева был построен и этот дом. К сожалению, документально подтвержденной даты постройки здания не имеется.

В 1969 году бригада специалистов во главе с Е.С. Староносовой при натурном обследовании во время составления документации на памятник архитектуры по архитектурно-стилистическим особенностям датировала дом Субботина XVIII веком. Однако Н. Кудрин в книге, посвященной описанию архитектурных памятников Великого Устюга «Запечатленная память», относит дом к первой четверти XIX века. Вслед за Н. Кудриным местный краевед С. К. Мальцев в книге «Великий Устюг: сохраненное и утраченное» также относит здание к началу XIX века, указывая конкретную дату – 1806 год. Датирование постройки дома началом XIX века представляется вполне возможным с учетом того, что на периферии смена архитектурных стилей происходила медленнее, поэтому дом начала XIX века мог выглядеть как постройка конца XVIII века.

Таким образом, обзор источников и литературы показывает, что даты постройки здания разняться, и дом мог быть возведен в период конца XVIII – начала XIX века. Но в информационной табличке с QR-кодом обозначен XVIII век, в связи с тем, что эта дата занесена в перечень объектов культурного наследия регионального значения, расположенных на территории Вологодской области. Однозначно можно утверждать, что дом построен по типовому проекту, т.к. он встает в один композиционный ряд с соседскими домами, стоящими на нынешнем Советском проспекте.

После смерти Дмитрия Николаевича Толоконцева дом перешел наследникам, затем был продан. Его новым владельцем в 1867 году стал купец Алексей Субботин, после него – Анна Николаевна Субботина.

После революции 1917 года дом, как и другие, перешел в собственность государства и в нем стали размещаться различного рода учреждения. Вот года размещения некоторых из них:

1921–1922 годы – губернский ревтрибунал,

1924–1931 годы – общежитие губернской совпартшколы,

1931 год – исполком городского Совета депутатов трудящихся,

1932–1934 годы - народный суд, нотариальная контора и прокуратура,

1935–1939 годы – снова общежитие совпартшколы.

В годы Великой Отечественной войны и послевоенные годы здание занимал ряд мелких учреждений, затем оно использовалось в качестве общежития учреждений среднего специального образования.